Published
2025-04-07
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克罗恩病和胰腺炎中的共同基因特征及生物学机制鉴定
胡 天媛
重庆医科大学
姜 政
重庆医科大学第一附属医院
DOI: https://doi.org/10.59429/xjjz.v7i1.9404
Keywords: 克罗恩病;胰腺炎;生物标志物;生物信息学
Abstract
目的:从基因综合表达数据库(GEO)中获取克罗恩病(CD)和胰腺炎的基因表达数据,通过筛选差异基 因和核心表型基因并进行功能分析,探索克罗恩病和胰腺炎的潜在发病机制。方法:在 GEO 数据库中检索 CD 和 胰腺炎的全血样本基因表达数据集,下载合适的数据集 GSE3365、GSE194331 的原始数据,筛选 CD 和胰腺炎的共 享差异表达基因(DEGs),并通过使加权基因共表达网络(WGCNA)筛选共同核心表型基因,在此基础上对共享 基因进行功能富集分析、蛋白质互作网络(PPI)和三种机器学习算法分析。结果:筛选出 32 个 DEGs 及 44 个共享 模块基因,功能富集分析强调了炎症趋化因子和细胞因子在这两种疾病机制中的重要性。PPI 分析识别出 9 个关键 枢纽基因。最终,通过三种机器学习算法确定了 4 具有潜在诊断价值的共享基因 PDGFB、IL10、IL6、FGF13。结 论:炎症反应的激活和调节、炎症后纤维化、脂质代谢的生物过程改变与 CD 并发胰腺炎的病程有关键作用,IL6、 PDGFB、IL10、FGF13 可认为是其预测因子,JAK-STAT 信号通路可能为其关键通路。
References
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